呼吸作用通指動植物等需氧生物的組織細胞吸進氧氣（或溶解氧），排出二氧化碳的作用；呼吸一般僅指動物通過呼吸器官（如肺、鰓等）從空氣或水中獲取氧的過程。

1、作用不同

呼吸，是指機體與外界環5261境之間氣體交換的過程。人的呼吸過程包括三個互相聯系的環節：外呼吸，包括肺通氣和肺換氣；氣體在血液中的運輸；內呼吸，指組織細胞與血液間的氣體交換。

生物體內的有機物在細胞內經過一系列的氧化分解，最終生成二氧化碳、尿酸或其他產物，并且釋放出能量的總過程，叫做呼吸作用。

2、過程不同

呼吸是機體和組織與周圍環境交換氣體，肺吸入氧氣呼出二氧化碳。

呼吸作用，是生物體在細胞內將有機物氧化分解并產生能量的化學過程，是所有的動物和植物都具有的一項生命活動。

3、工作原理不同

呼吸作用是一種酶促氧化反應。雖名為氧化反應，不論有無氧氣參與，都可稱作呼吸作用（這是因為在化學上，有電子轉移的反應過程，皆可稱為氧化還原反應）。有氧氣參與時的呼吸作用，稱之為有氧呼吸；沒氧氣參與的反應，則稱為無氧呼吸。

呼吸是機體和組織與周圍環境交換氣體的過程，肺吸氣和呼氣動作的全過程。